На Женевском автосалоне в марте 2011 года дебютировал Koenigsegg Agera R,  модификация суперкара Koenigsegg Agera, которая работает как на бензине, так и на биотопливе E85.Является один из самых быстрых в мире автомобилей серийного производства.

Движок V8 с объемом в 5,0-литров, с мощность в 1115 л.с. и крутящим моментом в 1000 Нм    оснащённый системой Twin Turbo, дает возможность разгонатся с места до 100 км/час за 2,9 секунд. Максимальная скорость ограничена в 375 км/ч, так как установленные шины Supersport фирмы Michelin способны выдерживать скорости только до 420 км/ч. Однако инженер-разработчик  утверждает, что, при наличии более выносливых шин и отсутствии встречного ветра, на прямой трассе Koenigsegg Agera R способна разогнаться до 440 км/ч. Вес автомобиля сведен к минимуму благодаря углеволоконному кузову и топливному баку из алюминиевых сот. Снаряженная масса составляет 1435 кг.

В 2012 году компания Koenigsegg представила обновлённую версию Koenigsegg Agera R.
Новый автомобиль получил приставку 2013 как обозначение года выпуска модели в серийное производство.

В отличие версии Agera R, обновлённая модель получила следующие улучшения: полностью новая задняя подвеска Triplex, фирменная система стабилизации под названием KES (Koenigsegg Electronic Stability), целиком выполненные из карбона колесные диски Aircore, единственной металлической деталью в которых является ниппель, а также облегченная система выхлопа и увеличенная производительность заднего диффузора  , новые гильзы цилиндров покрытые нано-покрытием, что позволяет уменьшить трение и как следствие расход топлива, система управления топливом, обеспечивающая дополнительную функциональность и соответствующая протоколу OBD II, увеличена мощности двигателя с 1115 до 1140 л.с. - при работе на биотопливе Е85, и повышены обороты двигателя с 6900 до 7100 об/мин, а также изменены боковые передние крылья нового Agera R обеспечивают дополнительные 20 кг прижимной силы на скорости 250 км/ч, и значительно снижают сопротивление. Вообще постарались на славу.

Ориентировочная стоимость Koenigsegg Agera R – 1 500 000 евро.